Videnskabeligt arbejde for at kurere Alzheimers gennem forsøg på aber lukkes ned. Tilbage står en slagen forsker med aben, Caesar, hvis intelligens leder til primaternes oprør mod menneskeheden. – Sådan var plottet i forgængeren til denne film, der nu tager os med ind i fremtiden med Caesar som anfører for et voksende samfund af genetisk udviklede aber. Et samfund, der en dag trues af en gruppe mennesker, som mirakuløst overlevede en dødelig virus for år tilbage. Mennesker og aber opnår en kortvarig forsoning, men står snart i hver sin lejr af en krig, der en gang for alle skal afgøre, hvilken race der skal herske på jorden.